Anti-DYKDDDDK Magarose Beads
1.产品介绍
Flag标签是一个由八个亲水 氨基酸组成的多肽片段,定位在融合蛋白表面,因此更易与对应抗体结合以及被肠激酶分解。Magarose Beads系列产品具有超顺磁性、快速磁响应性、丰富羟基官能团和相对集中的粒径等特点,是医学与分子生物学研究中重要的载体工具。Anti-DYKDDDDK Magarose Beads是以抗Flag (DYKDDDDK) 抗体为亲和配体,可-步纯化原核、酵母或哺乳动物细胞表达的flag标签融合蛋白。
表1. Anti-DYKDDDDK Magarose Beads产品性能
指标 | 性能 |
基质 | 高度交联的4%琼脂糖微球 |
配体 | Anti-DYKDDDDK人单克隆抗体 |
结合能力 | >1mg DYKDDDDK标签蛋白/ml 介质 |
粒径 (μm) | 45-165 |
最大压力 | 0.1MPa, 1 bar |
储存缓冲液 | 1×PBS,0.02%NaN3 |
储存温度 | 2-8°C |
2.试剂准备
2.1样品准备
上柱之前要确保样品溶液有合适的离子强度和pH值,可以用平衡液对样品或细胞培养液稀释,或者用平衡液透析。
样品在.上样前建议离心或用0.22 μm或0.45 um滤膜过滤,减少杂质,提高蛋白纯化效率和防止堵塞柱子。
2.2缓冲液的准备
所用水和缓冲液在使用之前建议用0.22 μm或0.45 um滤膜过滤。
平衡/洗杂液: 50 mM Tris, 0.15 M NaCl, pH7.4
洗脱液: 0.1 M Glycine-HCl, pH3.0
竞争性洗脱液: 50 mM Tris, 0.15 M NaCl, 100-500 ug flag多肽/ml, pH7.4
中和液: 1 M Tris-HCI, pH8.0
3.样品纯化
根据两种应用来介绍产品的使用方法:蛋白纯化流程和IP流程。
3.1磁珠预处理
将Anti-DYKDDDDK Magarose Beads颠倒数次,保证磁珠完全混匀,取计算量(根据样品体积和所含样品含量计算)的磁珠悬浮液,转移至离心管中,放置在磁分离器上,静置大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器吸弃清液。将离心管磁分离器上取下来,加入与悬浮液等体积的平衡液,使用枪头反复吹打5次,将离心管置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器吸弃清液,重复洗涤2次。
3.2 Flag标签蛋白纯化
1)磁珠结合目的蛋白:在步骤3.1预处理的磁珠管中加入样品溶液,漩涡振荡均匀,在室温下置于翻转混合仪或者手工轻轻翻转离心管,促使样品和磁珠充分接触并吸附,混合30 min以上(具体时间根据结合效果调整),置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸取并保留上清液,作为流穿样品,用于后续检测。
2)磁珠洗杂:向离心管中加入5倍磁珠体积的洗杂液,振荡悬浮,置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸弃上清液。该操作重复两次以上。
3)洗脱目的蛋白:
A酸性洗脱:
在上述离心管中加入3 5倍磁珠体积的酸性洗脱液(0.1 M Glycine-HCl, pH3.0), 用移液器吹打5次,然后在室温下置于翻转混合仪或者手工轻轻翻转离心管,5-10 min后,置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸取并保留上清液,为洗脱组份,即为目标蛋白。该操作建议重复两次。向洗脱组分中加入洗脱体积十分之一的中和液,调节pH值至7.0-8.0。
注:酸性洗脱后磁珠要立即用平衡液平衡, Anti-DYKDDDDK Magarose Beads在洗脱液中不要放置超过20 min。
B竞争性洗脱:
使用3-5倍磁珠体积的竞争性洗脱液(lag 多肽含量100 μg/ml)洗脱,2-8C孵育30 min,将离心管置于磁分离器上大约1 min,待溶液变澄清后,小心取出上清,不要吸到填料,为洗脱组份。洗脱样品放置4C,长时间放置20C保存。
C:变性洗脱:
此方法洗脱的样品适用于SDS-PAGE检测。SDS PAGE Loading Buffer中含有β巯基乙醇或DTT,可以使填料上抗体配体重链和轻链断开(大小分别为50和25 kDa)。另外所含有的SDS可以使Anti-DYKDDDDK抗体变性,洗脱后的Anti-DYKDDDDK Magarose Beads没办法重复使用。每管中加入磁珠体积等量的2XSDS-PAGE Loading Buffer, 95C加热10 min。将离心管置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸取上清SDS-PAGE电泳检测,也可以离心后取上清用于电泳检测。
注: Anti-DYKDDDDK Magarose Beads再生效果受限,请谨慎使用。
3.3 IP/Co-IP操作流程
1)磁珠结合靶蛋白:将含有Flag 标签的靶蛋白样品加入到步骤3.1处理好的磁珠中,颠倒混匀。将离心管置于混合仪上,室温孵育30 min以上(具体时间根据结合效果调整)。
2)磁珠洗杂:将离心管置于磁分离器,大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器移出上清液,保留,以备取样检测。向离心管中加入5倍悬浮液体积的洗杂液,使用枪头反复吹打5-10次,将离心管置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器吸弃上清液。重复上述步骤2次。即得到靶蛋白~磁珠复合物。如果进行的是IP实验,则跳过3、4两步,直接进行第5步。
3)目标蛋白与靶蛋白-磁珠复合物的结合:将含有目标蛋白样品加入到处理好的靶蛋白-磁珠复合物中,颠倒混匀。将离心管置于混合仪上,室温孵育30 min以上(具体时间根据结合效果调整)。
4)磁珠洗杂:将离心管置于磁分离器,大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器移出上清液,保留,以备取样检测。向离心管中加入5倍悬浮液体积的洗杂液,使用枪头反复吹打5-10次,将离心管置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,用移液器吸弃上清液。重复上述步骤2次。目标蛋白通过与靶蛋白的结合,从混合体系中被捕获。
5)洗脱目的蛋白:
A酸性洗脱:
在上述离心管中加入3-5倍磁珠体积的酸性洗脱液(0.1 M glycine HCI, pH3.0), 用移液器吹打5次,然后在室温下置于翻转混合仪或者手工轻轻翻转离心管,5-10 min后,置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸取并保留上清液,为洗脱组分,即为目标抗体。该操作建议重复两次。向洗脱组分中加入洗脱体积十分之一的中和液,调节pH值至7.0-8.0。
注:酸性洗脱后磁珠要立即用平衡液平衡,Anti-DYKDDDDK Magarose Beads在洗脱液中不要放置超过20 min。
B竞争性洗脱:
使用3-5倍磁珠体积的竞争性洗脱液(f1ag 多肽含量100 ug/ml)洗脱,2-8℃孵育30 min,将离心管置于磁分离器上大约1 min,待溶液变澄清后,小心取出上清,不要吸到填料,为洗脱组份。洗脱样品放置4C,长时间放置20℃保存。
C变性洗脱:
此方法洗脱的样品适用于SDS-PAGE检测。SDS-PAGE Loading Buffer中含有β巯基乙醇或DTT,可以使填料上抗体配体重链和轻链断开(大小分贝为50和25 kDa)。另外所含有的SDS可以使Anti-DYKDDDDK抗体变性,洗脱后的Anti-DYKDDDDK Magarose Beads没办法重复使用。每管中加入磁珠体积等量的2XSDS-PAGE Loading Buffer, 95C加热10 min。将离心管置于磁分离器上,大约1 min,待溶液变澄清后,吸取上清SDS-PAGE电泳检测,也可以离心后取上清用于电泳检测。
4.试剂兼容性
表2.Anti-DYKDDDDK mgarose Beads 试剂兼容性
试剂名称 | 最大耐受浓度 | 备注 |
β-巯基乙醇 | 10mM | 纯化过程中应避免使用,如果在IP中使用,填料不能回收重复使用 |
DTT | 80mM | |
SDS | - | |
EDTA | 5mM | 过高的EDTA会降低蛋白回收率 |
Tween-20 | 5% | 过高浓度会影响标签蛋白结合效率 |
Triton X-100 | 5% | |
NP40 | 4% | |
盐酸胍 | 0.3M | 过高浓度会使抗体变性 |
尿素 | 1.5M | |
甘油 | 20% | 过高浓度会影响标签蛋白结合效率 |
NaCl | 1M | 减少非特异性吸附 |
5.问题及解决方案
问题 | 原因分析 | 推荐解决方案 |
柱子反压过高 | 筛板被堵塞 | 清洗或更换筛板 |
填料被堵塞 | 按照第4部分进行树脂CIP清洗 | |
裂解液中含有微小的固体颗粒,建立上柱前过滤 | ||
样品纯化过程中曲线不稳 | 样品或buffer中有气泡 | 取出样品或柱子中的气泡 |
样品和buffer进行脱气 | ||
洗脱组分中没有目的蛋白 | 目的蛋白不稳定 | 使用新鲜样品 |
低温操作 | ||
细胞裂解液中加入蛋白酶抑制剂 | ||
样品中无标签融合蛋白 | 纯化前Western检测是否有flag标签蛋白 | |
回收率逐渐减低 | 上样量太多 | 减少上样量 |
柱子太脏 | 按照第4部分进行树脂CIP清洗 |
*本试剂仅供实验室研究使用