Anti-DYKDDDDK Affinity Beads
1.产品介绍
Flag标签是一个由八个亲水 氨基酸组成的多肽片段,定位在融合蛋白表面,因此更易与抗体结合以及被肠激酶分解。Anti-DYKDDDDK Affinity Beads是以抗Flag(DYKDDDDK)抗体为亲和配体,-步纯化原核、酵母或哺乳动物细胞表达的Flag标签融合蛋白。Anti-DYKDDDDK Affinity Beads以4%琼脂糖凝胶为基质,杂蛋白非特异性结合少,可用于Flag标签融合蛋白的纯化和免疫沉淀(IP)。
表1. Anti-c-Myc Affinity Beads产品性能
指标 | 性能 |
基质 | 高度交联的4%琼脂糖微球 |
配体 | Anti-DYKDDDDK人单克隆抗体 |
结合能力 | >1mg DYKDDDDK标签蛋白/ml 介质 |
粒径 (μm) | 45-165 |
最大压力 | 0.1MPa, 1 bar |
储存缓冲液 | 1×PBS,0.02%NaN3 |
储存温度 | 2-8°C |
2.试剂准备
2.1样品准备
上柱之前要确保样品溶液有合适的离子强度和pH值,可以用平衡液对样品或细胞培养液稀释,或者用平衡液透析。
样品在.上样前建议离心或用0.22 μm或0.45 μm滤膜过滤,减少杂质,提高蛋白纯化效率和防止堵塞柱子。
2.2缓冲液的准备
所用水和缓冲液在使用之前建议用0.22 μm或0.45 um滤膜过滤。
平衡/洗杂液: 50 mM Tris, 0.15 M NaCl, pH7.4
酸性洗脱液: 0.1 M glycine HCI, pH3.0
竞争性洗脱液: 50 mM Tris, 0.15 M NaCI, 100-500 μg flag多肽/ml, pH7.4
中和液: 1 M Tris-HCl, pH8.0
3.样品纯化
3.1柱层析
1)将Anti-DYKDDDDK Affinity Beads装入合适的层析柱,层析用5倍柱体积的平衡液进行平衡,使填料处于与目的蛋白相同的缓冲体系下。
2)将样品加到平衡好的Anti-DYKDDDDK Affinity Beads中,收集流出液,可以反复上样增加结合效率。
3)用10倍柱体积的洗杂液进行清洗,去除非特异性吸附的杂蛋白,收集洗杂液。
4)A酸性洗脱:使用5倍柱体积的酸性洗脱液洗脱,收集管中预先加好中和液,加入量15-25ul中和液/ml洗脱液,分管收集。注:酸性洗脱后填料要立即用平衡液平衡,Anti-DYKDDDDK Affinity Beads在洗脱液中不要超过20 min。
B竞争性洗脱:使用5倍柱体积的竞争性洗脱液洗脱。分管收集。
5)使用3倍柱体积的洗脱液再生,然后用平衡液平衡至中性。
6)然后保存在含0.02%叠氮化钠的PBS溶液中,2-8℃保存。
3.2静态吸附
1)填料准备:取适量的Anti-DYKDDDDK Affinity Beads加入层析柱中,流干保护液。加入5倍柱体积的平衡液清洗。
2)加入样品溶液,4℃或室温震荡孵育至少30 min(不能磁力搅拌),确保填料与样品溶液充分混合。
3)孵育完毕后,将填料混合液离心(5000xg 离心1 min)或过滤收集填料。
4)将填料装入层析柱中,用平衡液清洗直至紫外稳定。
5)用酸性洗脱液或竞争性洗脱液洗脱,参考3.1中4)。
6)填料再生和保存参考3.1中5)和6)。
3_3免疫沉淀操作流程
1)填料准备:取40 μl的Anti-DYKDDDDK Affinity Beads (柱体积20 u1)混合液加入到2 ml离心管中, 5000xg 离心1 min,吸弃上清。
2)填料加入0.5 ml平衡液,悬浮填料(使填料处于与目的蛋白相同的缓冲体系下,起到保护蛋白的作用), 5000xg离心1 min,吸弃上清。重复-次。
3)加入200-1000ul样品裂解液到处理好的填料中,混合均匀,在室温下置于翻转混合仪轻轻翻转离心管,促使样 品和填料充分接触并吸附,室温至少1h。5000xg 离心1 min,吸弃上清。
4)洗杂:加入0.5 ml的洗杂液,悬浮填料,轻轻混匀, 5000xg 离心1 min,吸弃上清。再重复三次。确保去除非特异性吸附。
5)样品洗脱:可根据后期检测的需要选择不同的洗脱方法。
A:酸性洗脱
加入100μl酸性洗脱液,悬浮填料。室温孵育5 min, 5000xg离心1 min。小心取出上清,不要吸到填料,用中和液中和。洗脱样品放置4℃,长时间放置20℃保存。
B:竞争性洗脱
加入100ul竞争性洗脱液洗脱。室温孵育30 min, 5000xg离心1 min。小心取出上清,不要吸到填料。洗脱样品放置4℃,长时间放置-20℃保存。
C:变性洗脱
实验室常规蛋白.上样缓冲液(Loading Buffer)中含有β巯基乙醇和DTT,可以使填料中抗体重链和轻链断开。含有SDS的样品缓冲液可以使Anti-DYKDDDDK抗体变性,洗脱后的Anti-DYKDDDDK Affinity Beads没办法重复使用。每管中加入20 ul 2x Loading Buffer, 95℃加热5min。5000xg 离心1 min,吸取上清SDS-PAGE电泳检测。
4.试剂兼容性
表2.Anti-DYKDDDDK Affinity Beads 试剂兼容性
试剂名称 | 最大耐受浓度 | 备注 |
β-巯基乙醇 | 10mM | 纯化过程中应避免使用,如果在IP中使用,填料不能回收重复使用 |
DTT | 80mM | |
SDS | - | |
EDTA | 5mM | 过高的EDTA会降低蛋白回收率 |
Tween-20 | 5% | 过高浓度会影响标签蛋白结合效率 |
Triton X-100 | 5% | |
NP40 | 4% | |
盐酸胍 | 0.3M | 过高浓度会使抗体变性 |
尿素 | 1.5M | |
甘油 | 20% | 过高浓度会影响标签蛋白结合效率 |
NaCl | 1M | 减少非特异性吸附 |
4.问题及解决方案
问题 | 原因分析 | 推荐解决方案 |
柱子反压过高 | 筛板被堵塞 | 清洗或更换筛板 |
填料被堵塞 | 按照第4部分进行树脂CIP清洗 | |
裂解液中含有微小的固体颗粒,建立上柱前过滤 | ||
样品纯化过程中曲线不稳 | 样品或buffer中有气泡 | 取出样品或柱子中的气泡 |
样品和buffer进行脱气 | ||
洗脱组分中没有目的蛋白 | 目的蛋白不稳定 | 使用新鲜样品 |
低温操作 | ||
细胞裂解液中加入蛋白酶抑制剂 | ||
样品中无标签融合蛋白 | 纯化前Western检测是否有c-myc标签蛋白 | |
回收率逐渐减低 | 上样量太多 | 减少上样量 |
柱子太脏 | 按照第4部分进行树脂CIP清洗 |
*本试剂仅供实验室研究使用