产品说明:
生物素3'末端DNA标记试剂盒(Biotin 3' End DNA Labeling Kit)能够利用终端脱氧核苷酸转移酶(Terminal Deoxynucleotidyl Transferase,TdT)将生物素标记的脱氧尿嘧啶三磷酸(dUTP)添加到DNA分子的3'末端。这种标记的优点是:不干扰杂交反应,不影响EMSA检测。该试剂盒标记的生物素化DNA探针适用于常见的核酸实验,包括Northern印迹、Southern印迹、EMSA凝胶迁移位移(也称为gel shift)、菌落杂交或原位杂交等。
终端脱氧核苷酸转移酶(TdT)能够在不依赖模板的情况下催化DNA分子3'末端与脱氧核苷三磷酸(dNTP)之间的连接反应。在TdT催化下,单链DNA分子3'末端与dNTP反应效率最高,其次依次是:3'端末端凸出的双链DNA分子,平端DNA分子。所以,我们尽可能让DNA处于单链的情况下进行标记,特别是对于EMSA实验,可先单链标记再进行退火步骤。
参照实验标准步骤标记,每次标记反应的DNA探针量约为5pmol。
本试剂盒特点:
1. 标记速度快,30分钟内完成标记;
2. 避免了使用同位素的危害和污染物的处理;
3. 标记产物稳定,可以长期存放一年;
4. 本试剂盒标记产物适合于多种分子生物学实验,干扰小。
试剂盒组分:
组分名称 | 组分说明 | |
12T | 25T | |
TdT Buffer(5X) | 150ul | 300ul |
TdT(10U/μl) | 15ul | 30ul |
Biotin-11-dUTP(5μM) | 65ul | 130ul |
标记终止液 | 200ul | 200ul |
TE | 1ml | 1ml |
ddH2O | 1ml | 1ml |
说明书 | 1份 |
保存条件:
-20℃保存。
其他需要准备的材料:
• 超纯水;
• 待标记DNA(1µM);
• PCR仪器,水浴锅或可设置37℃的金属浴;
• 氯仿/异戊醇Chloroform: isoamyl alcohol (24:1);
• 吸头和离心管
操作说明:
1. 准备工作:
将试剂盒中的各个组分恢复至室温(TdT酶务必放在-20℃,使用时放在冰盒上);
待标记的DNA片段调整至1μM;如果DNA为双链,请先变性为单链,标记效果会更好。
2. DNA探针的标记:
以下示例为每次标记5pmol DNA 3'-OH 末端最优配制。Mg2+、蛋白质和残留琼脂糖的存在可能会降低标记效率。 在以下反应中仅使用纯化的 DNA。再次强调: 对于双链 DNA 的标记,需要先将其变性后,标记效果会更好,使用之前将其退火复性。
2.1 按照以下体系配置反应体系
50ul反应体系设置如下:
ddH2O | 29μl |
TdT Buffer (5X) | 10μl |
待标记DNA探针(1μM) | 5μl |
Biotin-11-dUTP (5μM) | 5μl |
TdT (10U/μl) | 1μl |
总体积 | 50μl |
2.2 配制好以后轻轻混匀反应体系,PCR仪或者水浴锅上37℃反应30分钟。
2.3 加入2.5μl标记终止液,轻轻混匀终止反应。
2.4 加入52.5μl氯仿-异戊醇(24:1),振荡混匀;12,000-g离心3分钟。吸取上清即为被生物素标记的DNA探针。
3. 探针的纯化(可做步骤):
标记好的探针可以直接用于实验,但是为了追求更好是实验效果,可以按如下步骤进行纯化:
3.1 50ul标记好的探针,加入1/4体积(即12.5μl)的5M醋酸铵,再加入2体积(100μl)的冰冻无水乙醇,轻轻混匀;
3.2 -20℃沉淀过夜;
3.3 4℃,12,000g离心30分钟;离心完毕后,小心去除上清,保留沉淀,微晾干沉淀;
3.4 加入25μl TE,待其完全溶解沉淀;标记好的探针可以放在-20℃保存。