从单B细胞克隆和表达人单克隆抗体的策略
IgH 和 IgL 链基因通过巢式 RT-PCR 从单细胞 cDNA 中扩增,该 cDNA 是通过随机六聚体扩增产生的,然后连接到真核表达载体中。 使用对前导区具有特异性的正向引物混合物和对相应 IgH、Igκ 或 Igλ 恒定区具有特异性的反向引物进行第一次 PCR。 使用对 FWR1 具有特异性的正向引物混合物和对 IgH、Igκ 和 Igλ J 基因或恒定区具有特异性的相应嵌套反向引物进行第二次 PCR。 如果第二个PCR引物含有限制性位点,则对产物进行测序并直接克隆。 或者,为了避免使用引物混合物引入氨基酸交换以及为了克隆全长 Igκ 基因,对第二次 PCR 产物进行测序以确定各自的 V 和 J 基因。 之后,以第一次PCR产物为模板,使用含有限制性位点的V基因和J基因特异性引物进行另一轮扩增。 所有 PCR 产物在表达载体克隆之前和之后均进行测序。 为了生产重组抗体,将含有与原始 PCR 产物具有 100% 同一性的插入片段的质粒共转染至 HEK 293 细胞中,并在培养后从上清液中纯化抗体。
Source | B cell population | Phenotype |
---|---|---|
Bone marrow | Early immature | CD19+CD34−CD10+IgM− |
Immature | CD19+CD34−CD10+IgM+ | |
Peripheral blood | New emigrant | CD19+CD10+CD27−IgM+ |
Mature naive | CD19+CD10−CD27−IgM+ | |
IgM+ memory | CD19+CD10−CD27+IgM+ | |
IgG+ memory | CD19+CD10−CD27+IgG+ |
附2:相关引物序列:
Forward Primer | 5′ - 3′ sequence |
---|---|
5′ L-VH 1 | ACAGGTGCCCACTCCCAGGTGCAG |
5′ L-VH 3 | AAGGTGTCCAGTGTGARGTGCAG |
5′ L-VH 4/6 | CCCAGATGGGTCCTGTCCCAGGTGCAG |
5′ L-VH 5 | CAAGGAGTCTGTTCCGAGGTGCAG |
5′ AgeI VH1 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTGCAGCTGGTGCAG |
5′ AgeI VH1/5 | CTGCAACCGGTGTACATTCCGAGGTGCAGCTGGTGCAG |
5′ AgeI VH3 | CTGCAACCGGTGTACATTCTGAGGTGCAGCTGGTGGAG |
5′ AgeI VH3-23 | CTGCAACCGGTGTACATTCTGAGGTGCAGCTGTTGGAG |
5′ AgeI VH4 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTGCAGCTGCAGGAG |
5′ AgeI VH 4-34 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTGCAGCTACAGCAGTG |
5′ AgeI VH 1-18 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTTCAGCTGGTGCAG |
5′ AgeI VH 1-24 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTCCAGCTGGTACAG |
5′ AgeI VH3-33 | CTGCAACCGGTGTACATTCTCAGGTGCAGCTGGTGGAG |
5′ AgeI VH 3-9 | CTGCAACCGGTGTACATTCTGAAGTGCAGCTGGTGGAG |
5′ AgeI VH4-39 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGCTGCAGCTGCAGGAG |
5′ AgeI VH 6-1 | CTGCAACCGGTGTACATTCCCAGGTACAGCTGCAGCAG |
5′ L Vκ 1/2 | ATGAGGSTCCCYGCTCAGCTGCTGG |
5′ L Vκ 3 | CTCTTCCTCCTGCTACTCTGGCTCCCAG |
5′ L Vκ 4 | ATTTCTCTGTTGCTCTGGATCTCTG |
5′ Pan Vκ | ATGACCCAGWCTCCABYCWCCCTG |
5′ AgeI Vκ 1-5 | CTGCAACCGGTGTACATTCTGACATCCAGATGACCCAGTC |
5′ AgeI Vκ 1-9 | TTGTGCTGCAACCGGTGTACATTCAGACATCCAGTTGACCCAGTCT |
5′ AgeI Vκ 1D-43 | CTGCAACCGGTGTACATTGTGCCATCCGGATGACCCAGTC |
5′ AgeI Vκ 2-24 | CTGCAACCGGTGTACATGGGGATATTGTGATGACCCAGAC |
5′ AgeI Vκ 2-28 | CTGCAACCGGTGTACATGGGGATATTGTGATGACTCAGTC |
5′ AgeI Vκ 2-30 | CTGCAACCGGTGTACATGGGGATGTTGTGATGACTCAGTC |
5′ Age Vκ 3-11 | TTGTGCTGCAACCGGTGTACATTCAGAAATTGTGTTGACACAGTC |
5′ Age Vκ 3-15 | CTGCAACCGGTGTACATTCAGAAATAGTGATGACGCAGTC |
5′ Age Vκ 3-20 | TTGTGCTGCAACCGGTGTACATTCAGAAATTGTGTTGACGCAGTCT |
5′ Age Vκ 4-1 | CTGCAACCGGTGTACATTCGGACATCGTGATGACCCAGTC |
5′ L Vλ 1 | GGTCCTGGGCCCAGTCTGTGCTG |
5′ L Vλ 2 | GGTCCTGGGCCCAGTCTGCCCTG |
5′ L Vλ 3 | GCTCTGTGACCTCCTATGAGCTG |
5′ L Vλ 4/5 | GGTCTCTCTCSCAGCYTGTGCTG |
5′ L Vλ 6 | GTTCTTGGGCCAATTTTATGCTG |
5′ L Vλ 7 | GGTCCAATTCYCAGGCTGTGGTG |
5′ L Vλ 8 | GAGTGGATTCTCAGACTGTGGTG |
5′ AgeI Vλ 1 | CTGCTACCGGTTCCTGGGCCCAGTCTGTGCTGACKCAG |
5′ AgeI Vλ 2 | CTGCTACCGGTTCCTGGGCCCAGTCTGCCCTGACTCAG |
5′ AgeI Vλ 3 | CTGCTACCGGTTCTGTGACCTCCTATGAGCTGACWCAG |
5′ AgeI Vλ 4/5 | CTGCTACCGGTTCTCTCTCSCAGCYTGTGCTGACTCA |
5′ AgeI Vλ 6 | CTGCTACCGGTTCTTGGGCCAATTTTATGCTGACTCAG |
5′ AgeI Vλ 7/8 | CTGCTACCGGTTCCAATTCYCAGRCTGTGGTGACYCAG |
5′ Ab sense | GCTTCGTTAGAACGCGGCTAC |
Reverse Primer | 5′ - 3′ sequence |
3′ Cγ CH1 | GGAAGGTGTGCACGCCGCTGGTC |
3′ Cμ CH1 | GGGAATTCTCACAGGAGACGA |
3′ IgG (internal) | GTTCGGGGAAGTAGTCCTTGAC |
3′ SalI JH 1/2/4/5 | TGCGAAGTCGACGCTGAGGAGACGGTGACCAG |
3′ SalI JH 3 | TGCGAAGTCGACGCTGAAGAGACGGTGACCATTG |
3′ SalI JH 6 | TGCGAAGTCGACGCTGAGGAGACGGTGACCGTG |
3′ Cκ 543 | GTTTCTCGTAGTCTGCTTTGCTCA |
3′ Cκ 494 | GTGCTGTCCTTGCTGTCCTGCT |
3′ BsiWI Jκ 1/4 | GCCACCGTACGTTTGATYTCCACCTTGGTC |
3′ BsiWI Jκ 2 | GCCACCGTACGTTTGATCTCCAGCTTGGTC |
3′ BsiWI Jκ 3 | GCCACCGTACGTTTGATATCCACTTTGGTC |
3′ BsiWI Jκ 5 | GCCACCGTACGTTTAATCTCCAGTCGTGTC |
3′ Cλ | CACCAGTGTGGCCTTGTTGGCTTG |
3′ XhoI Cλ | CTCCTCACTCGAGGGYGGGAACAGAGTG |
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