Peptide Designer of Antigen Epitope Prediction
本使用说明书将介绍如何使用多肽抗原表位设计工具,以根据输入的蛋白质序列生成具有一定属性的多肽序列。请按照以下步骤操作:
步骤 1:输入蛋白质序列
1.在页面上找到名为“请输入蛋白质序列”的文本框。
2.在文本框中输入您要设计多肽的蛋白质序列。输入的序列应为字母 A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Y 的组合。
步骤 2:执行多肽设计
1.在页面上找到名为“多肽设计”的按钮。
2.点击“多肽设计”按钮,工具将根据您输入的蛋白质序列生成多肽序列。
步骤 3:查看设计结果
1.在页面上会显示设计结果的表格。
2.表格中将显示多肽序列的排名、起始位置、多肽序列本身以及相应的多肽分值。多肽分值是根据氨基酸属性计算得出的。
1.输入的蛋白质序列应为合法的氨基酸字母(A、C、D、E、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W、Y)组合。
2.设计结果将生成长度为 15 的多肽序列。每个多肽序列都以蛋白质序列中的某个氨基酸为起始位置,然后包括接下来的 14 个氨基酸。
3.多肽序列将根据氨基酸的亲水性和抗原指数属性进行评分。评分越高表示多肽在这些属性上越有优势。
4.设计结果将根据多肽分值进行排序,显示前 50 个多肽序列及其相应属性。
5.所设计的多肽序列仅供参考,具体的应用效果需要以实验结果为准。
6.在起始位置重复密集度高的区域,请根据具体情况择优选择多肽序列。
7.本软件输出的是 15 个氨基酸的多肽,您可以结合多肽重叠区域的情况,自行确定最终用于实验的多肽长度。
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